94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2034 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2034  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0517  hypothetical protein  79.89 
 
 
184 aa  307  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1423  hypothetical protein  58.93 
 
 
169 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  52.38 
 
 
168 aa  195  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3277  hypothetical protein  54.84 
 
 
176 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.567089  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3365  thioesterase-like  55.13 
 
 
179 aa  190  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  hitchhiker  0.00851583 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  54.49 
 
 
177 aa  190  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2025  thioesterase superfamily protein  54.49 
 
 
177 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.310445  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2737  hypothetical protein  51.59 
 
 
171 aa  185  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2438  hypothetical protein  47.1 
 
 
164 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.395574  normal  0.244804 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0346  hypothetical protein  37.84 
 
 
159 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4507  hypothetical protein  37.5 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2131  hypothetical protein  38.78 
 
 
160 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2174  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  36.3 
 
 
496 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0763  hypothetical protein  39.46 
 
 
165 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5233  hypothetical protein  39.31 
 
 
158 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2919  hypothetical protein  37.09 
 
 
158 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30598  normal  0.266429 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1956  hypothetical protein  38.78 
 
 
165 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0688  hypothetical protein  38.78 
 
 
165 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71120  hypothetical protein  37.67 
 
 
159 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.84981  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0853  hypothetical protein  38.78 
 
 
165 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0984  hypothetical protein  38.78 
 
 
165 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757206  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1846  thioesterase, putative  38.1 
 
 
165 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0493  hypothetical protein  38.78 
 
 
160 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2741  thioesterase, FcbC-like  38.41 
 
 
168 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0763545 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0825  hypothetical protein  37.84 
 
 
166 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.493019 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2186  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  37.01 
 
 
491 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6171  hypothetical protein  37.24 
 
 
159 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4457  thioesterase-like protein  39.19 
 
 
162 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0730992  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5440  hypothetical protein  35.1 
 
 
171 aa  100  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651867  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4907  hypothetical protein  34.87 
 
 
156 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0583702 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4977  thioesterase-like protein  38.51 
 
 
162 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603539  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0325  hypothetical protein  35.53 
 
 
158 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3966  thioesterase-like protein  36.88 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0769  hypothetical protein  34.01 
 
 
158 aa  99  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6430  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  34.27 
 
 
496 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93663  normal  0.0295637 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3591  thioesterase-like protein  37.84 
 
 
162 aa  98.2  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479418  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0385  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  97.4  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3318  thioesterase-like  37.84 
 
 
162 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0744427  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3283  hypothetical protein  34 
 
 
163 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5049  thioesterase-like protein  37.84 
 
 
162 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5235  thioesterase-like protein  37.84 
 
 
162 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0614  thioesterase-like  37.84 
 
 
162 aa  97.1  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3172  hypothetical protein  36.59 
 
 
161 aa  95.9  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0321  hypothetical protein  33.55 
 
 
156 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.163836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0301  hypothetical protein  32.24 
 
 
156 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0502  thioesterase-like protein  33.99 
 
 
158 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3827  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  38.73 
 
 
466 aa  91.3  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2923  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  34.75 
 
 
491 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5042  hypothetical protein  37.68 
 
 
154 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119922  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4493  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  33.57 
 
 
496 aa  85.5  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.733703  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16240  predicted thioesterase  37.41 
 
 
144 aa  85.1  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2359  hypothetical protein  33.79 
 
 
162 aa  85.1  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.61 
 
 
375 aa  84.7  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1939  hypothetical protein  32.87 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1019  hypothetical protein  31.03 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0102733  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2418  hypothetical protein  30.07 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2372  hypothetical protein  30.07 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1342  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7697  thioesterase-like  29.45 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.479271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2825  hypothetical protein  35.48 
 
 
391 aa  72.4  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5073  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  32.39 
 
 
484 aa  72.4  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459353  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4150  hypothetical protein  33.57 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216159  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6305  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  28.78 
 
 
165 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
143 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
138 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  28 
 
 
143 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  30.43 
 
 
297 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  31.82 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
138 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
145 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
145 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  24.82 
 
 
153 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  24.09 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  28.36 
 
 
151 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
142 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4807  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
140 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.777198  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1848  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
140 aa  42.4  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149836  normal  0.418825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 
147 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 
147 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  27.5 
 
 
181 aa  42  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 
147 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  27.5 
 
 
181 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.98 
 
 
149 aa  42  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  27.5 
 
 
149 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  27.5 
 
 
149 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  27.5 
 
 
149 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  27.5 
 
 
149 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  24.8 
 
 
148 aa  41.6  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  24.82 
 
 
153 aa  41.2  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>