67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4507 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4507  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  343  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0825  hypothetical protein  93.98 
 
 
166 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.493019 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3283  hypothetical protein  78.4 
 
 
163 aa  262  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0688  hypothetical protein  68.99 
 
 
165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0984  hypothetical protein  68.99 
 
 
165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757206  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0853  hypothetical protein  68.99 
 
 
165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1956  hypothetical protein  68.99 
 
 
165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0763  hypothetical protein  68.35 
 
 
165 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288362  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0493  hypothetical protein  68.99 
 
 
160 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1846  thioesterase, putative  67.09 
 
 
165 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2131  hypothetical protein  68.35 
 
 
160 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3318  thioesterase-like  65.22 
 
 
162 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0744427  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5049  thioesterase-like protein  65.22 
 
 
162 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5235  thioesterase-like protein  65.22 
 
 
162 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0614  thioesterase-like  64.6 
 
 
162 aa  200  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4457  thioesterase-like protein  63.98 
 
 
162 aa  200  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0730992  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4977  thioesterase-like protein  63.98 
 
 
162 aa  200  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603539  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3591  thioesterase-like protein  64.6 
 
 
162 aa  200  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479418  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3966  thioesterase-like protein  60.98 
 
 
165 aa  195  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6171  hypothetical protein  54.9 
 
 
159 aa  170  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0502  thioesterase-like protein  55.26 
 
 
158 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71120  hypothetical protein  55.56 
 
 
159 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.84981  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5233  hypothetical protein  52.29 
 
 
158 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0325  hypothetical protein  54.55 
 
 
158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0321  hypothetical protein  52.29 
 
 
156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.163836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4907  hypothetical protein  52.6 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0583702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0301  hypothetical protein  51.3 
 
 
156 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2919  hypothetical protein  50 
 
 
158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30598  normal  0.266429 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0769  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  130  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0346  hypothetical protein  41.83 
 
 
159 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1423  hypothetical protein  42.18 
 
 
169 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0385  hypothetical protein  38.56 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2034  hypothetical protein  37.5 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  37.41 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7697  thioesterase-like  40.52 
 
 
159 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.479271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0517  hypothetical protein  37.33 
 
 
184 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3365  thioesterase-like  38.46 
 
 
179 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  hitchhiker  0.00851583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2737  hypothetical protein  34.16 
 
 
171 aa  104  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3172  hypothetical protein  41.18 
 
 
161 aa  103  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2025  thioesterase superfamily protein  38.19 
 
 
177 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.310445  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2438  hypothetical protein  35.71 
 
 
164 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.395574  normal  0.244804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  36.91 
 
 
177 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16240  predicted thioesterase  41.89 
 
 
144 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2186  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  40.85 
 
 
491 aa  99  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2359  hypothetical protein  34.19 
 
 
162 aa  98.2  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3277  hypothetical protein  36.05 
 
 
176 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.567089  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5073  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  43.94 
 
 
484 aa  97.8  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459353  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1019  hypothetical protein  38.69 
 
 
175 aa  97.4  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0102733  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1342  thioesterase superfamily protein  44.54 
 
 
150 aa  97.4  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2174  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  37.76 
 
 
496 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6430  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  40.29 
 
 
496 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93663  normal  0.0295637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5042  hypothetical protein  41.83 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119922  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2923  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  35.71 
 
 
491 aa  85.5  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4493  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  39.86 
 
 
496 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.733703  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.17 
 
 
375 aa  84.3  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6305  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  32.47 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3827  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  36.23 
 
 
466 aa  82.4  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1939  hypothetical protein  29.73 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2825  hypothetical protein  38.52 
 
 
391 aa  77.4  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2741  thioesterase, FcbC-like  32.61 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0763545 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2418  hypothetical protein  27.92 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2372  hypothetical protein  27.92 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5440  hypothetical protein  30.71 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651867  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4150  hypothetical protein  26.21 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216159  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4140  hypothetical protein  25.3 
 
 
179 aa  47.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3072  thioesterase-like protein  28.57 
 
 
145 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  26.32 
 
 
297 aa  41.2  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>