68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2741 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2741  thioesterase, FcbC-like  100 
 
 
168 aa  350  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0763545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1423  hypothetical protein  40.28 
 
 
169 aa  110  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  37.32 
 
 
177 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2034  hypothetical protein  38.41 
 
 
184 aa  104  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0517  hypothetical protein  37.34 
 
 
184 aa  103  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3277  hypothetical protein  39.86 
 
 
176 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.567089  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2438  hypothetical protein  38.46 
 
 
164 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.395574  normal  0.244804 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3365  thioesterase-like  36.43 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  hitchhiker  0.00851583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  34.51 
 
 
168 aa  98.2  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2737  hypothetical protein  35.66 
 
 
171 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2025  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
177 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.310445  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5042  hypothetical protein  39.44 
 
 
154 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119922  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1939  hypothetical protein  32.39 
 
 
158 aa  90.9  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0385  hypothetical protein  34.69 
 
 
158 aa  89  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0769  hypothetical protein  35 
 
 
158 aa  88.6  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3827  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  39.44 
 
 
466 aa  87  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3318  thioesterase-like  35.25 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0744427  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5235  thioesterase-like protein  35.25 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5049  thioesterase-like protein  35.25 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3966  thioesterase-like protein  34.93 
 
 
165 aa  84  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0346  hypothetical protein  33.55 
 
 
159 aa  84  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0614  thioesterase-like  34.53 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3591  thioesterase-like protein  33.8 
 
 
162 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479418  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4907  hypothetical protein  32.65 
 
 
156 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0583702 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4457  thioesterase-like protein  33.81 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0730992  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4977  thioesterase-like protein  33.81 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603539  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0321  hypothetical protein  33.1 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.163836 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2174  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  34.97 
 
 
496 aa  81.3  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0825  hypothetical protein  34.06 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.493019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0325  hypothetical protein  36.67 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16240  predicted thioesterase  37.1 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1846  thioesterase, putative  31.88 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4507  hypothetical protein  32.61 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3172  hypothetical protein  32.87 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2186  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  37.04 
 
 
491 aa  73.2  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2131  hypothetical protein  31.88 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2825  hypothetical protein  37.39 
 
 
391 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1956  hypothetical protein  31.88 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0301  hypothetical protein  34.78 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0853  hypothetical protein  31.88 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0984  hypothetical protein  31.88 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757206  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0688  hypothetical protein  31.88 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0493  hypothetical protein  31.88 
 
 
160 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6430  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  32.39 
 
 
496 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93663  normal  0.0295637 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0763  hypothetical protein  31.88 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288362  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3283  hypothetical protein  30.66 
 
 
163 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5440  hypothetical protein  35.83 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651867  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5073  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  35.82 
 
 
484 aa  70.9  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459353  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1342  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5233  hypothetical protein  30.5 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1019  hypothetical protein  32.48 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0102733  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71120  hypothetical protein  34.06 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.84981  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2919  hypothetical protein  29.73 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30598  normal  0.266429 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.5 
 
 
375 aa  68.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2923  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  31.69 
 
 
491 aa  69.3  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6171  hypothetical protein  34.06 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0502  thioesterase-like protein  30.71 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2359  hypothetical protein  27.5 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2372  hypothetical protein  28.93 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4493  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  33.06 
 
 
496 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.733703  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2418  hypothetical protein  28.93 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6305  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  27.78 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4150  hypothetical protein  30.95 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216159  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7697  thioesterase-like  29.85 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.479271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  31.97 
 
 
297 aa  48.5  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4140  hypothetical protein  29.14 
 
 
179 aa  47.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0254  hypothetical protein  28.16 
 
 
316 aa  41.2  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.695454  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4823  thioesterase superfamily protein  23.28 
 
 
148 aa  40.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>