66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0825 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0825  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  334  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.493019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4507  hypothetical protein  93.98 
 
 
169 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3283  hypothetical protein  80.86 
 
 
163 aa  267  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0688  hypothetical protein  70.06 
 
 
165 aa  217  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1956  hypothetical protein  70.06 
 
 
165 aa  217  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0984  hypothetical protein  70.06 
 
 
165 aa  217  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757206  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0853  hypothetical protein  70.06 
 
 
165 aa  217  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0493  hypothetical protein  70.06 
 
 
160 aa  216  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0763  hypothetical protein  69.43 
 
 
165 aa  216  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288362  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1846  thioesterase, putative  68.15 
 
 
165 aa  215  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2131  hypothetical protein  69.43 
 
 
160 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5049  thioesterase-like protein  67.3 
 
 
162 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5235  thioesterase-like protein  67.3 
 
 
162 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3318  thioesterase-like  67.3 
 
 
162 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0744427  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0614  thioesterase-like  66.67 
 
 
162 aa  203  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3591  thioesterase-like protein  66.67 
 
 
162 aa  202  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479418  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4457  thioesterase-like protein  66.04 
 
 
162 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0730992  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4977  thioesterase-like protein  66.04 
 
 
162 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603539  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3966  thioesterase-like protein  62.35 
 
 
165 aa  193  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0502  thioesterase-like protein  55.92 
 
 
158 aa  174  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6171  hypothetical protein  54.9 
 
 
159 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71120  hypothetical protein  55.56 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.84981  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5233  hypothetical protein  51.63 
 
 
158 aa  167  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0321  hypothetical protein  52.94 
 
 
156 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.163836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4907  hypothetical protein  53.25 
 
 
156 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0583702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0325  hypothetical protein  54.19 
 
 
158 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0301  hypothetical protein  52.6 
 
 
156 aa  163  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2919  hypothetical protein  52.26 
 
 
158 aa  157  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30598  normal  0.266429 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0769  hypothetical protein  40.13 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0346  hypothetical protein  42.58 
 
 
159 aa  127  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1423  hypothetical protein  42.47 
 
 
169 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0385  hypothetical protein  38.67 
 
 
158 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7697  thioesterase-like  42.48 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.479271 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16240  predicted thioesterase  42.57 
 
 
144 aa  107  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3365  thioesterase-like  37.18 
 
 
179 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  hitchhiker  0.00851583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  36.02 
 
 
168 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3172  hypothetical protein  43.97 
 
 
161 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2034  hypothetical protein  37.84 
 
 
184 aa  104  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2025  thioesterase superfamily protein  38.19 
 
 
177 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.310445  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2438  hypothetical protein  36.13 
 
 
164 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.395574  normal  0.244804 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2737  hypothetical protein  34.57 
 
 
171 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  38.03 
 
 
177 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1342  thioesterase superfamily protein  46.22 
 
 
150 aa  100  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5073  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  45.45 
 
 
484 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459353  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0517  hypothetical protein  37.41 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3277  hypothetical protein  36.05 
 
 
176 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.567089  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2174  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  36.36 
 
 
496 aa  97.1  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2359  hypothetical protein  33.12 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6430  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  38.85 
 
 
496 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93663  normal  0.0295637 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1019  hypothetical protein  37.95 
 
 
175 aa  95.9  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0102733  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2186  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  40.14 
 
 
491 aa  95.1  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5042  hypothetical protein  42.48 
 
 
154 aa  94.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119922  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4493  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  39.86 
 
 
496 aa  87.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.733703  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2923  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  35.71 
 
 
491 aa  87  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6305  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  33.12 
 
 
165 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.9 
 
 
375 aa  84.3  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3827  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  35.04 
 
 
466 aa  81.3  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2741  thioesterase, FcbC-like  34.06 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0763545 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1939  hypothetical protein  30.14 
 
 
158 aa  79  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2825  hypothetical protein  38.52 
 
 
391 aa  75.9  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2372  hypothetical protein  29.03 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2418  hypothetical protein  29.03 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5440  hypothetical protein  32.14 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651867  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4140  hypothetical protein  26.57 
 
 
179 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4150  hypothetical protein  26.21 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  25.78 
 
 
297 aa  45.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>