71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0502 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0502  thioesterase-like protein  100 
 
 		 158 aa  322  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6171  hypothetical protein  64.52 
 
 		 159 aa  207  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71120  hypothetical protein  65.16 
 
 		 159 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.84981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5233  hypothetical protein  61.54 
 
 		 158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4907  hypothetical protein  58.55 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0583702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2919  hypothetical protein  56.77 
 
 		 158 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30598  normal  0.266429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0321  hypothetical protein  55.92 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.163836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3283  hypothetical protein  54.9 
 
 		 163 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0301  hypothetical protein  57.24 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0825  hypothetical protein  55.92 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.493019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0325  hypothetical protein  56.77 
 
 		 158 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3591  thioesterase-like protein  54.49 
 
 		 162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5049  thioesterase-like protein  53.85 
 
 		 162 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4507  hypothetical protein  55.26 
 
 		 169 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4457  thioesterase-like protein  53.21 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0730992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3318  thioesterase-like  53.85 
 
 		 162 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0744427  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5235  thioesterase-like protein  53.85 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4977  thioesterase-like protein  53.21 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1846  thioesterase, putative  50.64 
 
 		 165 aa  166  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2131  hypothetical protein  52.26 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0763  hypothetical protein  52.26 
 
 		 165 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288362  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0493  hypothetical protein  52.26 
 
 		 160 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1956  hypothetical protein  52.26 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0853  hypothetical protein  52.26 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0984  hypothetical protein  52.26 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757206  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0688  hypothetical protein  52.26 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0614  thioesterase-like  51.28 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3966  thioesterase-like protein  47.8 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0346  hypothetical protein  39.6 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0769  hypothetical protein  42.67 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3172  hypothetical protein  48.34 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0385  hypothetical protein  40 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2923  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  41.43 
 
 		 491 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7697  thioesterase-like  38.82 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.479271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2025  thioesterase superfamily protein  40.27 
 
 		 177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.310445  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3365  thioesterase-like  40.94 
 
 		 179 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  hitchhiker  0.00851583 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3277  hypothetical protein  38.93 
 
 		 176 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.567089  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  39.19 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16240  predicted thioesterase  40.54 
 
 		 144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1342  thioesterase superfamily protein  45.3 
 
 		 150 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2186  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  38 
 
 		 491 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2737  hypothetical protein  41.1 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6430  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  38.03 
 
 		 496 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93663  normal  0.0295637 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1019  hypothetical protein  35.98 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0102733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  39.04 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4493  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  39.31 
 
 		 496 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.733703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5073  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  41.48 
 
 		 484 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1423  hypothetical protein  36.62 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.14 
 
 		 375 aa  97.1  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2174  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  35.21 
 
 		 496 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5042  hypothetical protein  39.86 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119922  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2438  hypothetical protein  34.03 
 
 		 164 aa  92.8  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.395574  normal  0.244804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2034  hypothetical protein  33.99 
 
 		 184 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2359  hypothetical protein  41.53 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6305  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  36.18 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3827  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  36.99 
 
 		 466 aa  90.1  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0517  hypothetical protein  30.34 
 
 		 184 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2825  hypothetical protein  40 
 
 		 391 aa  83.6  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2372  hypothetical protein  32.89 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2418  hypothetical protein  32.89 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1939  hypothetical protein  28.67 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2741  thioesterase, FcbC-like  30.71 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0763545 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5440  hypothetical protein  25.17 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  26.56 
 
 		 297 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4140  hypothetical protein  22.3 
 
 		 179 aa  50.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1149  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1179  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4150  hypothetical protein  27.27 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216159  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.23 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  23.53 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  25.41 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>