67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1794 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  100 
 
 
130 aa  271  3e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  68.99 
 
 
130 aa  189  9e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  30.3 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 
156 aa  67  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  29.46 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  31.3 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  28.93 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  28.24 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  28.24 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
136 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
154 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  28.68 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 
130 aa  60.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  28.23 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  31.97 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  25 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  28.32 
 
 
255 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  23.08 
 
 
247 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  25.2 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  25 
 
 
318 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  25.58 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  23.39 
 
 
132 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  23.53 
 
 
148 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0502  thioesterase-like protein  25.41 
 
 
158 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  21.9 
 
 
246 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  21.9 
 
 
246 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  24.09 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  22.12 
 
 
247 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  21.9 
 
 
246 aa  43.9  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  23.08 
 
 
139 aa  43.5  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.62 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0268  acyl-ACP thioesterase  24.59 
 
 
231 aa  42  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000883261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.58 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.95 
 
 
134 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.33 
 
 
159 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  25.19 
 
 
129 aa  41.2  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  21.9 
 
 
255 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.95 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  23.15 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.45 
 
 
375 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
153 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2359  hypothetical protein  22.05 
 
 
162 aa  40  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>