123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1929 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
136 aa  278  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  59.7 
 
 
136 aa  183  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  43.31 
 
 
130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  41.41 
 
 
164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  42.64 
 
 
132 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  38.89 
 
 
129 aa  96.3  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  37.4 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  37.8 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  38.17 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  37.68 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3508  hypothetical protein  41.05 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  31.78 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  30.23 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  42.48 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  32.03 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  31.25 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  30.23 
 
 
164 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  29.46 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
156 aa  60.1  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2484  hypothetical protein  26.4 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.838963  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  32 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  28.8 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
136 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  29.46 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1852  thioesterase  29.86 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304931  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  26.4 
 
 
140 aa  50.8  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2632  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.51 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  25 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  24.41 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.36 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0158  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
283 aa  47.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  28.68 
 
 
247 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1644  hypothetical protein  29.77 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.996621  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  30.25 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3175  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.67 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  23.62 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  31.67 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  24.41 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  29.71 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1214  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.859401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  25.58 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  28.46 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2560  hypothetical protein  31.25 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2613  hypothetical protein  31.25 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
163 aa  44.3  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.92 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.64 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  25.64 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1701  hypothetical protein  34.02 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.58 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
180 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  23.97 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.43 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.12 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  24.22 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  24.35 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0686  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.61 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  23.77 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0749  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.82 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  32.14 
 
 
254 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  24.06 
 
 
143 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  24.06 
 
 
143 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
143 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  24.06 
 
 
143 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>