87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2168 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  100 
 
 		 153 aa  320  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  95.42 
 
 		 153 aa  306  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  85.62 
 
 		 153 aa  261  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  85.11 
 
 		 144 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  83.69 
 
 		 144 aa  250  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  83.69 
 
 		 144 aa  250  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  82.98 
 
 		 144 aa  248  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  82.27 
 
 		 145 aa  239  9e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  80.14 
 
 		 149 aa  238  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  81.56 
 
 		 145 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  72 
 
 		 130 aa  185  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  53.24 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  50.35 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  50.36 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  49.63 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  50.37 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  46.1 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  45.19 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  43.28 
 
 		 140 aa  123  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  40.88 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  35.04 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  29.93 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  31.71 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  33.06 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  31.54 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  31.3 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  30.33 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.36 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.8 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 283 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  28.03 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.23 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  21.49 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  21.49 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.64 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.58 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.63 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  34.43 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  24.59 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  26.89 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1533  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1450  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  25.56 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.53 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  24.44 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  27.64 
 
 		 255 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.28 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.7 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  22.63 
 
 		 252 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45600  hypothetical protein  25.62 
 
 		 131 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  29.17 
 
 		 144 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 133 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  24.31 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.9 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.95 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  25 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1013  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.82 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505536  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.5 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  29.75 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.890214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>