130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1613 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
129 aa  263  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
143 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  43.31 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  44.44 
 
 
144 aa  107  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  39.37 
 
 
134 aa  107  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  45.04 
 
 
283 aa  103  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  39.42 
 
 
148 aa  103  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  43.09 
 
 
137 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  43.09 
 
 
132 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  42.74 
 
 
146 aa  99  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  38.58 
 
 
167 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
148 aa  94.4  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
146 aa  93.6  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  43.09 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 
181 aa  90.5  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  39.34 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  41.27 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  36.88 
 
 
183 aa  85.1  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  35.37 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  33.33 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2028  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  67  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1386  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.402075  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  31.5 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  27.33 
 
 
182 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4068  hypothetical protein  31.2 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  31.11 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3613  hypothetical protein  31.01 
 
 
137 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3686  hypothetical protein  31.01 
 
 
137 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3618  hypothetical protein  31.01 
 
 
137 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0859  hypothetical protein  31.06 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  33.6 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2570  hypothetical protein  28.57 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  29.51 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  32.54 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  32.54 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 
158 aa  53.9  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  32.03 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
139 aa  52  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
144 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
144 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
144 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  28.78 
 
 
173 aa  50.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.78 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  26.23 
 
 
137 aa  50.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  36.21 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.83 
 
 
142 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
153 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
150 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
140 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
142 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  26.27 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  28.81 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  21.95 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  29.82 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  21.93 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 
162 aa  43.9  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  24.35 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  30.97 
 
 
163 aa  42.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 
145 aa  42.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  23.58 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  34.67 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>