88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2293 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  100 
 
 		 163 aa  342  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  37.31 
 
 		 129 aa  100  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  33.59 
 
 		 130 aa  92  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 145 aa  91.3  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  30.3 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  32.58 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  33.61 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  32.06 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  32.06 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  29.93 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  29.03 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  30.43 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  30.51 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  31.54 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  26.67 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  30.66 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.93 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  25.62 
 
 		 246 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  26.98 
 
 		 254 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  26.45 
 
 		 246 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  26.45 
 
 		 246 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3508  hypothetical protein  28.97 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  31.11 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1852  thioesterase  21.97 
 
 		 139 aa  48.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304931  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  26.98 
 
 		 255 aa  47.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  26.52 
 
 		 318 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 		 283 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  26.17 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  30.53 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  29.66 
 
 		 247 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  26.81 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.81 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2484  hypothetical protein  25.74 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.838963  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  25.69 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3997  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.74 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.666415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  30.65 
 
 		 138 aa  44.3  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.74 
 
 		 150 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  37.33 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  22.13 
 
 		 247 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.55 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  26.92 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  25.23 
 
 		 253 aa  42  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 136 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  22.48 
 
 		 135 aa  42  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5307  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  23.58 
 
 		 253 aa  41.6  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.55 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 156 aa  40.8  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  21.97 
 
 		 141 aa  40.8  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1075  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 134 aa  40.4  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  27.45 
 
 		 134 aa  40.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.28 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>