41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3236 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  100 
 
 
255 aa  519  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  50.2 
 
 
247 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  45.11 
 
 
254 aa  192  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  33.33 
 
 
252 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  33.33 
 
 
246 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  33.33 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  30.2 
 
 
253 aa  125  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  32.13 
 
 
246 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  32.16 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  33.87 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29285  predicted protein  30.35 
 
 
332 aa  119  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1334  Acyl-ACP thioesterase-like  32.38 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  29.22 
 
 
247 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2253  acyl-ACP thioesterase  29.32 
 
 
256 aa  106  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1153  acyl-ACP thioesterase  28.29 
 
 
243 aa  105  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6353  acyl-ACP thioesterase  28.51 
 
 
247 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2035  acyl-ACP thioesterase  32.62 
 
 
248 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1725  acyl-ACP thioesterase  29.36 
 
 
249 aa  102  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.329649  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2461  acyl-ACP thioesterase  26.78 
 
 
252 aa  95.1  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0251  acyl-ACP thioesterase  25.75 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000581314  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  28.64 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  25.3 
 
 
252 aa  92  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0377  Acyl-ACP thioesterase  24.19 
 
 
244 aa  87  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000890944  hitchhiker  0.000000869045 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  26.67 
 
 
253 aa  87.8  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2218  hypothetical protein  26.2 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0283  Acyl-ACP thioesterase  24.2 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0635  acyl-ACP thioesterase  23.64 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  25.76 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2637  acyl-ACP thioesterase family protein  23.36 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000017914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2954  acyl-ACP thioesterase family protein  23.36 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000617099  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2031  acyl-ACP thioesterase  25.88 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13580  acyl-ACP thioesterase  23.92 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1215  acyl-ACP thioesterase, putative  23.98 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000117573  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1253  Acyl-ACP thioesterase  27.01 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2590  acyl-ACP thioesterase  24.49 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0335  acyl-ACP thioesterase  24.8 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0891  hypothetical protein  23.04 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.587244  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1403  Acyl-ACP thioesterase  26.72 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0268  acyl-ACP thioesterase  21.24 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000883261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  26.98 
 
 
163 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23720  acyl-ACP thioesterase  21.23 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000256541  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>