47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0436 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  100 
 
 
132 aa  270  4.0000000000000004e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  60.48 
 
 
130 aa  159  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  42.64 
 
 
136 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  46.22 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  41.74 
 
 
136 aa  95.9  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  35.11 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3508  hypothetical protein  38.3 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  34.06 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  29.03 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  30.33 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  33.04 
 
 
145 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  33.04 
 
 
145 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
154 aa  58.9  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  26.56 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  25.2 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.5 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  27.13 
 
 
164 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 
158 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  23.39 
 
 
135 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  27.91 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
283 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
154 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  26.95 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  27.07 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  22.31 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.12 
 
 
128 aa  40.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>