68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1535 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
154 aa  315  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  47.14 
 
 
136 aa  123  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  46.43 
 
 
135 aa  122  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  37.4 
 
 
163 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  31.85 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  37.68 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
130 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  31.16 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  32.85 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  29.32 
 
 
130 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.46 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  29.84 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  27.82 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  29.84 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  36.23 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  30.33 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  28.36 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  29.37 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  29.27 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  38.05 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  27.73 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  28.47 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  28.81 
 
 
254 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  25.93 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
132 aa  47  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3508  hypothetical protein  33.64 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  32.87 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  26.28 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1852  thioesterase  25 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304931  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
132 aa  44.3  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 
200 aa  43.9  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  29.2 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  22.79 
 
 
253 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  28.33 
 
 
255 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.76 
 
 
115 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
145 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1692  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.662828  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.43 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0283  Acyl-ACP thioesterase  21.64 
 
 
243 aa  41.2  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  27.55 
 
 
253 aa  40.8  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  27.13 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  25.37 
 
 
136 aa  40.8  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>