54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1290 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 156 aa  327  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  47.79 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  47.79 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  47.06 
 
 		 145 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  47.79 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  47.79 
 
 		 144 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  46.32 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  45.19 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  45.04 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  41.03 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  42.25 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  41.67 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  39.74 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  46.28 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 		 156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  37.24 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  33.09 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  33.61 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  28.57 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  32.06 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.92 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  28.93 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1179  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1149  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  27.12 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4077  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  32.47 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1852  thioesterase  26.32 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304931  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4502  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.83 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0635  acyl-ACP thioesterase  23.33 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  32.05 
 
 		 132 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0104  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 142 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0454736  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  21.88 
 
 		 162 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  24.65 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  22.73 
 
 		 132 aa  42  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  24.79 
 
 		 318 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0641  thioesterase superfamily protein  24.22 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 138 aa  41.2  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  24.62 
 
 		 134 aa  40.4  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>