118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_23630 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  298  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  97.24 
 
 
145 aa  292  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  85.42 
 
 
144 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  84.03 
 
 
144 aa  254  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  83.1 
 
 
149 aa  254  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  84.03 
 
 
144 aa  254  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  84.72 
 
 
144 aa  254  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  83.69 
 
 
153 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  82.98 
 
 
153 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  81.56 
 
 
153 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  70.31 
 
 
130 aa  190  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  55.56 
 
 
154 aa  170  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  52.45 
 
 
158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  51.82 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  50.36 
 
 
164 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  47.41 
 
 
156 aa  150  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  51.09 
 
 
164 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 
156 aa  144  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  44.12 
 
 
140 aa  135  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  43.48 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  33.58 
 
 
140 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  33.05 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  32.06 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  32.06 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.18 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.46 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  28.24 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.45 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  33.04 
 
 
132 aa  60.1  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  31.82 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.84 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.41 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
149 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.67 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.77 
 
 
134 aa  50.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
166 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  23.02 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  28.99 
 
 
318 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.48 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  27.14 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  32.22 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  31.4 
 
 
255 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.81 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1533  hypothetical protein  30.16 
 
 
131 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1450  hypothetical protein  30.16 
 
 
131 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.6 
 
 
133 aa  47  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  30.19 
 
 
135 aa  47  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
136 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
136 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  25.21 
 
 
138 aa  47  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3172  hypothetical protein  27.05 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.54 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1075  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  25.2 
 
 
252 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.43 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0066  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2201  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
283 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  25 
 
 
253 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1019  hypothetical protein  25.78 
 
 
175 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0102733  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  31.01 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  25.37 
 
 
150 aa  42  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.28 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  24.41 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  31.88 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.46 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.37 
 
 
150 aa  42  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  26.77 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  27.34 
 
 
155 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  27.97 
 
 
144 aa  41.6  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  33.85 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.85 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1170  hypothetical protein  27.93 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456722  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  22.22 
 
 
155 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  22.22 
 
 
155 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  21.9 
 
 
150 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0003  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
125 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00198303  unclonable  0.00000000031845 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>