46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0710 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
164 aa  334  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  41.41 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  41.09 
 
 
136 aa  107  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  46.22 
 
 
132 aa  99.8  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  40.52 
 
 
130 aa  98.2  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  36 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 
139 aa  87  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 
136 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  33.33 
 
 
163 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3508  hypothetical protein  40.19 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 
134 aa  77  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  36.09 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
136 aa  62.4  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 
153 aa  52  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.92 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 
158 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  25 
 
 
153 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  25.58 
 
 
130 aa  47.4  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  26.67 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  25.83 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 
144 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  30.83 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
283 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 
153 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
180 aa  44.3  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
132 aa  43.9  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
136 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  22.39 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  47.37 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  31.9 
 
 
255 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
134 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
156 aa  42  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0859  hypothetical protein  24.39 
 
 
133 aa  42  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  47.37 
 
 
164 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 
158 aa  40.8  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  23.66 
 
 
140 aa  40.4  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>