119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5390 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 139 aa  286  7e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  77.27 
 
 		 136 aa  212  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  79.55 
 
 		 134 aa  209  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 164 aa  87  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  37.8 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  35.71 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  30.7 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  35.65 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  32.48 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.5 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  26.56 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.03 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3508  hypothetical protein  32.69 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2632  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.71 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  30.5 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  32.58 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.58 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.2 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0148  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.4 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0924  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.31 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0795864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  29.17 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  29.17 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  29.17 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  29.17 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  29.17 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  29.17 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  29.27 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0787  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.85 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267485  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3175  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.87 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  25.71 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  27.14 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  27.46 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 130 aa  47.4  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.61 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  27.14 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  25.36 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4057  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.58 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 		 283 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5307  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.05 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  29.69 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3616  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.17 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1214  thioesterase superfamily protein  28.16 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.859401  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  26.98 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0277  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.67 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.51 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3114  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 156 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2484  hypothetical protein  23.08 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.838963  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  22.76 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4765  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.09 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  23.44 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  28.7 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  31.76 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  25.18 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0749  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.42 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1852  thioesterase  24.39 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304931  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 132 aa  42.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5232  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.22 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200026  normal  0.202993 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1849  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.41 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124156  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  28.16 
 
 		 252 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  28.91 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2228  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.34 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.159905  hitchhiker  0.000289051 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0258  thioesterase  23.01 
 
 		 141 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024858  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.35 
 
 		 129 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3072  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.82 
 
 		 169 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  25.49 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>