92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1852 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1852  thioesterase  100 
 
 		 139 aa  291  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304931  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  27.78 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  28.23 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  25.78 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  23.2 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  23.2 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  23.2 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  23.2 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  24 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  24 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  24 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  24 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  24 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  24 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  24.22 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  24 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1854  hypothetical protein  26.5 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  24 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  22.48 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  29.86 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.19 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.05 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3010  thioesterase-like protein  24.6 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  21.97 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4370  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.327633  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  28.35 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  23.44 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  31.17 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  23.14 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4734  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1215  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.4 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  23.48 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  25.98 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4807  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.777198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0172  thioesterase superfamily protein  38 
 
 		 313 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  24.39 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1601  thioesterase superfamily protein  22.76 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  26.4 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  26.55 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  24.22 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  31.52 
 
 		 156 aa  42.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  33.75 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  25.22 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 149 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  30 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 142 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  26.96 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  22.4 
 
 		 136 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  23.91 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 		 200 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1869  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 341 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  28.7 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  24 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1238  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.106775  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.36 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  29.35 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 		 176 aa  40.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4363  thioesterase-like protein  29.89 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  28.93 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4340  thioesterase-like protein  29.89 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408761  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  32.89 
 
 		 213 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>