270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1101 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
137 aa  286  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  75.19 
 
 
132 aa  207  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  74.8 
 
 
132 aa  202  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  74.8 
 
 
132 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  74.8 
 
 
132 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  74.8 
 
 
132 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  74.8 
 
 
132 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  74.02 
 
 
132 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  74.02 
 
 
132 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  74.02 
 
 
132 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  74.02 
 
 
132 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  74.02 
 
 
132 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  74.02 
 
 
132 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  74.02 
 
 
132 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  74.02 
 
 
132 aa  199  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  74.02 
 
 
132 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  72.22 
 
 
132 aa  198  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  65.91 
 
 
135 aa  190  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  65.91 
 
 
135 aa  190  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  70.63 
 
 
132 aa  188  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  65.15 
 
 
135 aa  187  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1601  thioesterase superfamily protein  36.15 
 
 
137 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812398  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  37.5 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  33.67 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.13 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  33.96 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  30.6 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  30.6 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
140 aa  60.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  33.62 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0258  thioesterase  31.58 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.19 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.76 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
135 aa  57.8  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2906  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  34.04 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  26.76 
 
 
180 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.09 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00696  predicted acyl-CoA thioesterase  33.65 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000730216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.65 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  33.65 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1852  thioesterase  22.48 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304931  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0658  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  33.65 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013537  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  33.65 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 
132 aa  52.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  33.65 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  33.65 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0765  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  33.65 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133795  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2919  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  33.65 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000323269  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1152  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  33.65 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  28.69 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 
136 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.69 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.13 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1234  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.77 
 
 
134 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.128192 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4734  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
138 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2872  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  31.43 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000275881  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3091  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  32.69 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2960  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  31.43 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0218826  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  28.85 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02688  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.41 
 
 
124 aa  50.8  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000607478  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0780  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  31.73 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000472439  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  29.91 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0871  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  31.73 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0203461  normal  0.184267 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0807  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  31.73 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000852325  normal  0.479233 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0902  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  31.73 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000167631  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0840  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  31.73 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  0.646292 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2718  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.06 
 
 
142 aa  50.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.401419  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
152 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  26.4 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.1 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.43 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1090  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.48 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.46 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  29.17 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.71 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.72 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
283 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0557  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  27.18 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.38 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1245  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.81 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0111113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  28.09 
 
 
175 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1533  hypothetical protein  31.4 
 
 
131 aa  47.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>