274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06649 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  100 
 
 
150 aa  315  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  91.33 
 
 
150 aa  295  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  64.54 
 
 
149 aa  198  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  57.58 
 
 
141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  58.59 
 
 
142 aa  168  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  57.36 
 
 
154 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  56.59 
 
 
154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  55.47 
 
 
144 aa  164  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  51.05 
 
 
143 aa  164  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  56.59 
 
 
146 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  56.59 
 
 
150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  55.81 
 
 
142 aa  163  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  57.03 
 
 
150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  56.59 
 
 
150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  56.59 
 
 
142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  52.14 
 
 
140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  55.81 
 
 
154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  44.68 
 
 
146 aa  154  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  53.03 
 
 
142 aa  153  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.73 
 
 
144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  35 
 
 
161 aa  99.4  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
139 aa  97.1  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 
161 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 
161 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  26.12 
 
 
137 aa  82  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  32.84 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  33.05 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  33.05 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04590  conserved hypothetical protein  28.68 
 
 
291 aa  70.9  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  26.12 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  31.65 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  30.23 
 
 
134 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  25.68 
 
 
180 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  28.68 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  31.45 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  25.37 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  27.07 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  25.53 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  25.55 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  25.37 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.35 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 
162 aa  57.4  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  34.34 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 
162 aa  57  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  22.96 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  29.03 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  44.64 
 
 
213 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 
188 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  29.21 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  33.65 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
175 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  26.47 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03599  conserved hypothetical protein  25.15 
 
 
294 aa  54.3  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.06 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 
145 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.06 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.06 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  24.24 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.06 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  24.82 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>