141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0715 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  279  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 
138 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  33.67 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
132 aa  66.6  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  32.26 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  36.47 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  36.47 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  36.47 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  31.63 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  31.63 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  31.63 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  31.63 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  31.63 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  31.63 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  31.63 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  31.63 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  31.63 
 
 
132 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  26.45 
 
 
175 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0701  hypothetical protein  26.47 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00299166  normal  0.252492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4356  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.509436 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  27.19 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2773  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 
181 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000495096 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1601  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812398  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4208  thioesterase-like  26.09 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0607121  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  36.78 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1894  acyl-CoA thioester hydrolase  32.47 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4363  thioesterase-like protein  26.09 
 
 
150 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3069  hypothetical protein  29.25 
 
 
181 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4340  thioesterase-like protein  26.09 
 
 
150 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408761  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2629  thioesterase-like protein  28.35 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293891  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  27.83 
 
 
297 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2560  hypothetical protein  27.27 
 
 
181 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1179  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  23.76 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1149  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3139  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.05 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  29.37 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1013  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.96 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  39.19 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  39.19 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0641  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.17 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 
213 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 
200 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.93 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  23.93 
 
 
183 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  32.1 
 
 
134 aa  47  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  23.81 
 
 
167 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  23.81 
 
 
145 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  25.37 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.37 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  37.31 
 
 
147 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2112  hypothetical protein  25.56 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.461535 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.37 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  28.05 
 
 
162 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.61 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  37.7 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
283 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2100  thioesterase-like protein  21.97 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118365  normal  0.0327511 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  27.85 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4823  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5117  hypothetical protein  24.59 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357034  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  25.42 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003917  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.39 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0190272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.63 
 
 
148 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0020  hypothetical protein  24.3 
 
 
181 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  21.28 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02175  hypothetical protein  23.33 
 
 
158 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3613  hypothetical protein  27.91 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.69 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  67.86 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3686  hypothetical protein  27.91 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3618  hypothetical protein  27.91 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0474  hypothetical protein  24.58 
 
 
134 aa  43.5  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.637818  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2570  hypothetical protein  25.2 
 
 
139 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4375  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16240  predicted thioesterase  24.3 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.63 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0916  thioesterase superfamily protein  26.21 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  54.84 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>