41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5117 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5117  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  332  9e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2885  hypothetical protein  85.71 
 
 		 147 aa  266  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2100  thioesterase-like protein  76.87 
 
 		 147 aa  239  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118365  normal  0.0327511 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2091  hypothetical protein  75.51 
 
 		 147 aa  226  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45600  hypothetical protein  64.84 
 
 		 131 aa  178  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3800  hypothetical protein  60 
 
 		 141 aa  175  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1456  esterase  48.57 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.711822  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0454  hypothetical protein  40.71 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1883  hypothetical protein  38.13 
 
 		 142 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3257  esterase  40 
 
 		 142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1354  esterase  38.19 
 
 		 143 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1601  esterase  38.03 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  41.61 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0338  hypothetical protein  38.06 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0349  hypothetical protein  38.06 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2228  hypothetical protein  37.06 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00481735  hitchhiker  0.000000503639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3335  esterase  39.13 
 
 		 118 aa  87  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  33.33 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2881  putative thioesterase  39.73 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.510611 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  24.22 
 
 		 143 aa  51.2  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  25.62 
 
 		 135 aa  48.5  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  23.08 
 
 		 132 aa  47.4  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  22.13 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  24.59 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  23.08 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  26.55 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  21.31 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  21.49 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  21.49 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  24.11 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  20.49 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  20.66 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  20.49 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  21.55 
 
 		 132 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 		 132 aa  41.2  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  23.73 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  20.3 
 
 		 139 aa  40.4  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>