41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2091 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2091  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  305  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2100  thioesterase-like protein  76.19 
 
 
147 aa  233  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118365  normal  0.0327511 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5117  hypothetical protein  75.51 
 
 
161 aa  226  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357034  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2885  hypothetical protein  71.43 
 
 
147 aa  218  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3800  hypothetical protein  59.29 
 
 
141 aa  180  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45600  hypothetical protein  62.5 
 
 
131 aa  175  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1456  esterase  45.71 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.711822  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1354  esterase  35.42 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0454  hypothetical protein  37.86 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3257  esterase  36.43 
 
 
142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1883  hypothetical protein  37.41 
 
 
142 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488202  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1601  esterase  36.62 
 
 
142 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2228  hypothetical protein  37.06 
 
 
151 aa  103  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00481735  hitchhiker  0.000000503639 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0338  hypothetical protein  34.81 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0349  hypothetical protein  34.81 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 
145 aa  97.4  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3335  esterase  35.65 
 
 
118 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  28.35 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2881  putative thioesterase  40.28 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.510611 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  28.68 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  22.95 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  19.84 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  23.62 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  24.8 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  25.18 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  24.8 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  24.8 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  23.66 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  26.45 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  21.26 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  22.45 
 
 
148 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  24.14 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  23.31 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  26.45 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  23.85 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  23.36 
 
 
153 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  23.14 
 
 
135 aa  40  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>