62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1601 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1601  esterase  100 
 
 
142 aa  289  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1354  esterase  50.75 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1456  esterase  44.06 
 
 
141 aa  130  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.711822  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3257  esterase  41.13 
 
 
142 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3800  hypothetical protein  37.76 
 
 
141 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2100  thioesterase-like protein  39.86 
 
 
147 aa  110  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118365  normal  0.0327511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0454  hypothetical protein  36.88 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1883  hypothetical protein  34.27 
 
 
142 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488202  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2091  hypothetical protein  36.62 
 
 
147 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5117  hypothetical protein  38.03 
 
 
161 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357034  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2885  hypothetical protein  36.62 
 
 
147 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2228  hypothetical protein  39.42 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00481735  hitchhiker  0.000000503639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3335  esterase  41.88 
 
 
118 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45600  hypothetical protein  38.89 
 
 
131 aa  90.1  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0338  hypothetical protein  32.35 
 
 
147 aa  87  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0349  hypothetical protein  32.35 
 
 
147 aa  86.7  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  34.88 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 
162 aa  57  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2881  putative thioesterase  36.71 
 
 
82 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.510611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  23.02 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3686  hypothetical protein  27.34 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3618  hypothetical protein  27.34 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3613  hypothetical protein  27.34 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  27.82 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  23.13 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  22.73 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  23.02 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  21.37 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  23.08 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  22.7 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.06 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.06 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2570  hypothetical protein  23.62 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  23.44 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.06 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 
149 aa  43.5  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.06 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  20.59 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  23.08 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  22.06 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.06 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.06 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  23.4 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  24.19 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  24.41 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4068  hypothetical protein  23.62 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  24.82 
 
 
144 aa  41.2  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  22.39 
 
 
147 aa  41.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.06 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  19.08 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  21.26 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.31 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>