218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1898 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
140 aa  295  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  91.43 
 
 
140 aa  274  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  80.58 
 
 
139 aa  246  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  76.26 
 
 
139 aa  236  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  75.54 
 
 
140 aa  230  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  70.29 
 
 
156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  63.7 
 
 
147 aa  197  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  52.71 
 
 
142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
133 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  44.2 
 
 
139 aa  141  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  51.59 
 
 
134 aa  141  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  51.61 
 
 
132 aa  140  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  48.84 
 
 
147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  50.39 
 
 
143 aa  136  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  50.39 
 
 
143 aa  136  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  50.39 
 
 
143 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  50.39 
 
 
146 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  50.39 
 
 
146 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  48.8 
 
 
133 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
132 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  44.52 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  47.69 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  47.69 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  47.69 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  47.69 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  47.69 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  47.69 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  42.54 
 
 
136 aa  120  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  42.64 
 
 
139 aa  114  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  53.4 
 
 
213 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 
135 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  31.54 
 
 
134 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  30.77 
 
 
134 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  32.58 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 
136 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  31.34 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  36.22 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  29.46 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  25.56 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  28.57 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  34.92 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  34.92 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
140 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  25.81 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.66 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  29.13 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  24.11 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.03 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  39.19 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  24.48 
 
 
151 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
131 aa  60.1  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
175 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  24 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  30.36 
 
 
161 aa  57  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.98 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  24.19 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
145 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  24.19 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
151 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  28 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  32.67 
 
 
167 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  26.95 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>