204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2820 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  306  9e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  61.03 
 
 
137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  60.74 
 
 
135 aa  176  7e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  60.74 
 
 
135 aa  176  7e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  60.74 
 
 
135 aa  176  7e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  61.54 
 
 
135 aa  175  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  48.46 
 
 
136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  48.84 
 
 
133 aa  136  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  42.75 
 
 
133 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  46.51 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  46.15 
 
 
129 aa  122  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 
136 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 
136 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 
136 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 
136 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 
136 aa  122  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 
136 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  41.6 
 
 
134 aa  121  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  41.6 
 
 
136 aa  121  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  44.63 
 
 
135 aa  120  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  39.2 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.52 
 
 
138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  40.94 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  40.48 
 
 
134 aa  116  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 
135 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  43.2 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  40.5 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  41.27 
 
 
134 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 
155 aa  107  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  37.68 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 
140 aa  94  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  32.64 
 
 
149 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  32.8 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  28.15 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
146 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
146 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  30.77 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  30.77 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
132 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  30.77 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  30.77 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
136 aa  62  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  30.77 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  30.77 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  30.77 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  29.91 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  29.91 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
140 aa  60.5  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  30.4 
 
 
147 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  32.23 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
139 aa  58.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  25.37 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  30 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.56 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.56 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.56 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  26.56 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.56 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.56 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.58 
 
 
148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.72 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 
132 aa  53.9  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
141 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>