270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_27910 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  276  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  91.04 
 
 
134 aa  258  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  69.4 
 
 
136 aa  203  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  47.15 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  46.51 
 
 
139 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 
136 aa  124  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  40.3 
 
 
143 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  41.79 
 
 
147 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  39.55 
 
 
143 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  39.55 
 
 
143 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 
133 aa  120  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  42.28 
 
 
132 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  39.85 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  39.85 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  38.81 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  42.97 
 
 
133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  40.65 
 
 
134 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  41.94 
 
 
130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  39.23 
 
 
130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 
132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  40.3 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  40.3 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  40.3 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  40.3 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  40.3 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  40.3 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  40.3 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
139 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  40.44 
 
 
134 aa  103  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  40.77 
 
 
135 aa  101  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
213 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  36.15 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
139 aa  84  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
143 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  37.04 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 
175 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  32.23 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  32.81 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  40.85 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  42.65 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  41.1 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  32.28 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  28.36 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  31.45 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  32.26 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  32.26 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  32.26 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  32.26 
 
 
181 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  32.26 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  32.26 
 
 
181 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  30.95 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.88 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.95 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.95 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.95 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.95 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.95 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  32.18 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
146 aa  62  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  33.72 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  34.12 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>