More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0382 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 143 aa  296  9e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  82.27 
 
 		 143 aa  246  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  73.13 
 
 		 147 aa  215  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  71.22 
 
 		 147 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  65.25 
 
 		 143 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  67.16 
 
 		 150 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  64.93 
 
 		 150 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  59.15 
 
 		 175 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  62.14 
 
 		 148 aa  184  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  59.86 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  58.33 
 
 		 203 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  56.74 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  56.74 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  61.19 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  61.19 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  61.94 
 
 		 149 aa  180  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  60.29 
 
 		 145 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  61.03 
 
 		 145 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  61.03 
 
 		 145 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  62.22 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  63.16 
 
 		 153 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  59.56 
 
 		 145 aa  176  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  61.7 
 
 		 163 aa  176  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  58.52 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  57.86 
 
 		 145 aa  173  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  59.85 
 
 		 160 aa  173  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  58.21 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  59.38 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  59.38 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  59.38 
 
 		 149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  59.38 
 
 		 149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  59.38 
 
 		 149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  59.38 
 
 		 149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  56.52 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  58.96 
 
 		 188 aa  169  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  55.73 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  57.97 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  59.26 
 
 		 150 aa  167  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  54.07 
 
 		 164 aa  167  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  56.3 
 
 		 147 aa  166  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  52.82 
 
 		 153 aa  166  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  53.68 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  55.22 
 
 		 162 aa  164  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  55.8 
 
 		 145 aa  164  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  52.48 
 
 		 153 aa  164  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  52.63 
 
 		 136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  55.22 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  54.61 
 
 		 155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  51.41 
 
 		 153 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  59.09 
 
 		 137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  53.68 
 
 		 137 aa  160  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  51.88 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 		 155 aa  155  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  52.27 
 
 		 156 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  48.91 
 
 		 138 aa  153  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  50.35 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  54.14 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  51.85 
 
 		 150 aa  146  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  57.52 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  52.99 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  52.24 
 
 		 143 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 		 146 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  46.76 
 
 		 146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  46.92 
 
 		 147 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  46.92 
 
 		 147 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  46.92 
 
 		 147 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  45.99 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  46.04 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  47.01 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  41.83 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  41.61 
 
 		 149 aa  117  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  39.42 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  33.61 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  35.19 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 		 286 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  32.52 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  32.82 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 		 287 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 		 289 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 292 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  32.09 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.65 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  32.09 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  31.65 
 
 		 287 aa  67.4  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  32.28 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.11 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 		 287 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.55 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  30.33 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>