222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0966 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
145 aa  294  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  90.21 
 
 
145 aa  265  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  76.98 
 
 
153 aa  224  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  78.1 
 
 
153 aa  224  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  76.81 
 
 
153 aa  222  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  64.83 
 
 
175 aa  197  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  65.28 
 
 
145 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  63.89 
 
 
145 aa  194  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  64.58 
 
 
145 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  64.58 
 
 
145 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  64.58 
 
 
145 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  63.89 
 
 
145 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  67.14 
 
 
203 aa  193  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  64.08 
 
 
149 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  65.71 
 
 
147 aa  191  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  66.91 
 
 
147 aa  190  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  66.91 
 
 
147 aa  189  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  65.97 
 
 
163 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  66.18 
 
 
149 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  66.18 
 
 
181 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  66.18 
 
 
149 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  66.18 
 
 
149 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  66.18 
 
 
181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  67.16 
 
 
149 aa  187  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  64.34 
 
 
150 aa  185  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  64.54 
 
 
153 aa  181  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  64.14 
 
 
155 aa  181  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  64.79 
 
 
147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  60.56 
 
 
164 aa  180  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  60.84 
 
 
149 aa  179  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  57.86 
 
 
148 aa  178  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  62.96 
 
 
142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  61.27 
 
 
156 aa  177  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  63.38 
 
 
162 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  61.27 
 
 
144 aa  176  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  62.68 
 
 
162 aa  175  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  61.38 
 
 
150 aa  174  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  65.91 
 
 
153 aa  173  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  66.17 
 
 
160 aa  173  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  62.04 
 
 
188 aa  167  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  59.44 
 
 
143 aa  166  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  59.44 
 
 
143 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  55.8 
 
 
143 aa  164  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  57.46 
 
 
136 aa  163  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  56.43 
 
 
143 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  69.03 
 
 
125 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  58.39 
 
 
147 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  57.14 
 
 
147 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  57.25 
 
 
142 aa  159  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  57.35 
 
 
137 aa  157  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  53.24 
 
 
148 aa  157  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  52.86 
 
 
155 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  54.89 
 
 
143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  52.59 
 
 
150 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 
150 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  51.91 
 
 
142 aa  149  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  46.98 
 
 
151 aa  147  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 
143 aa  146  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  51.88 
 
 
138 aa  144  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  53.44 
 
 
137 aa  142  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  55.22 
 
 
150 aa  140  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  48.57 
 
 
147 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  48.57 
 
 
147 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  48.57 
 
 
147 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  45.14 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  49.65 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  43.57 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  37.24 
 
 
146 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 
146 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 
146 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  34.87 
 
 
169 aa  97.8  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  29.51 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  34.59 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  34.68 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  31.65 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  34.45 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  34.17 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  34.17 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  34.17 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  34.17 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  34.17 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  34.17 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  29.51 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  35.77 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  32.77 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>