252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2619 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
140 aa  285  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  57.86 
 
 
144 aa  177  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  62.31 
 
 
147 aa  174  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  61.54 
 
 
147 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  51.54 
 
 
148 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  49.61 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  41.8 
 
 
154 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  47.86 
 
 
141 aa  110  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  39.34 
 
 
142 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  38.64 
 
 
151 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 
157 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  43.33 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  40.54 
 
 
163 aa  73.6  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  37.39 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  39.37 
 
 
139 aa  67  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  33.85 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  33.85 
 
 
181 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  33.59 
 
 
203 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  33.85 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  33.85 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  33.85 
 
 
181 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  33.85 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
155 aa  62.8  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  28.46 
 
 
154 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  34.26 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  30.95 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  31.36 
 
 
147 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
156 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  27.69 
 
 
154 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  37.07 
 
 
153 aa  60.5  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  31.25 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6384  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  32.14 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  31.19 
 
 
130 aa  58.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  29.09 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
175 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  31.25 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
149 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  26.98 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  28.74 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  28.95 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1681  putative Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  27.27 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  0.0917493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.44 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  29.87 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  33.93 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
153 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  30.17 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  30.12 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  28.81 
 
 
135 aa  53.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  28.81 
 
 
135 aa  53.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>