97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4859 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 134 aa  277  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  77.44 
 
 		 134 aa  224  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  81.25 
 
 		 134 aa  221  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  74.44 
 
 		 135 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  68.42 
 
 		 134 aa  202  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  68.42 
 
 		 136 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  68.42 
 
 		 136 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  68.42 
 
 		 136 aa  200  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  77.42 
 
 		 132 aa  200  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  68.42 
 
 		 136 aa  200  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  68.42 
 
 		 136 aa  200  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  68.42 
 
 		 138 aa  199  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  67.67 
 
 		 136 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  67.67 
 
 		 136 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  67.67 
 
 		 136 aa  196  9e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  65.67 
 
 		 155 aa  191  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  47.62 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  50 
 
 		 139 aa  133  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  44.8 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  46.83 
 
 		 135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  40.8 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  42.52 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  42.52 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  42.52 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  40.48 
 
 		 147 aa  116  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  38.58 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  39.68 
 
 		 135 aa  110  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 133 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  40.62 
 
 		 129 aa  107  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 140 aa  94.7  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  26.62 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  29.77 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  26.12 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  26.32 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  24.03 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 162 aa  50.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  23.53 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  24 
 
 		 283 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.62 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  27.45 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  24.44 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  25.95 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  25.56 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0817  thioesterase family protein  24.79 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0988  thioesterase family protein  23.62 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0576476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  24.22 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  31.08 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  31.08 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6384  thioesterase superfamily protein  51.61 
 
 		 156 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 158 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  26.27 
 
 		 147 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  24.76 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  24.03 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  23.85 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.6 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  25.78 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  24.55 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  25.41 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.67 
 
 		 133 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>