121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0145 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
135 aa  286  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  63.49 
 
 
139 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  51.16 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  49.61 
 
 
133 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
134 aa  136  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  52.5 
 
 
136 aa  133  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 
155 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  54.31 
 
 
132 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  50.79 
 
 
138 aa  130  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  49.57 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
135 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
136 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
136 aa  128  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  51.69 
 
 
136 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 
136 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 
136 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  51.69 
 
 
136 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 
134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  46.83 
 
 
134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  41.91 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  42.64 
 
 
136 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  45.8 
 
 
135 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  45.8 
 
 
135 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  45.8 
 
 
135 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  45.04 
 
 
135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  42.34 
 
 
147 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  45.69 
 
 
129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  39.06 
 
 
133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  41.88 
 
 
140 aa  97.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  39.68 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 
149 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  24.8 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  30.83 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  27.59 
 
 
130 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
130 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
155 aa  51.6  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 
144 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  24.8 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  28.57 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  32.03 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  27.59 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  23.48 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  26.83 
 
 
137 aa  47.4  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  30.51 
 
 
147 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  24.46 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2186  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  24.58 
 
 
491 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  23.85 
 
 
145 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  30.51 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  30.51 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  21.48 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  24.22 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  23.85 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  30.51 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  30.51 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  30.51 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  30.51 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  30.51 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.93 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.93 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.93 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.93 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>