192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6384 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6384  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
156 aa  315  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4436  hypothetical protein  38.13 
 
 
158 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  42.66 
 
 
150 aa  97.8  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  35.86 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  38.53 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  34.13 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  30.83 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  27.91 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  30.67 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  31.39 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  31.62 
 
 
147 aa  62.4  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  32.68 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
140 aa  60.8  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  25.6 
 
 
129 aa  59.7  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.1 
 
 
148 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.1 
 
 
148 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.1 
 
 
148 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  26.36 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  26.36 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  26.36 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  31.87 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.85 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  31.47 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  28.15 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  43.33 
 
 
134 aa  57.4  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  29.1 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.1 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.1 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  30.07 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  31.47 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  38.52 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  40.66 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  26.09 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.1 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
283 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  27.86 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.36 
 
 
148 aa  54.3  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  29.71 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  31.69 
 
 
139 aa  53.9  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  27.91 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  29.79 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  29.37 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  28.47 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  34.03 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 
131 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 
148 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 
133 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 
135 aa  50.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
161 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  29.17 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  30.34 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  28 
 
 
130 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  26.47 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
136 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
136 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
139 aa  48.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
136 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>