111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0929 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  100 
 
 
131 aa  276  8e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  49.61 
 
 
136 aa  151  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  51.16 
 
 
135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  50.77 
 
 
133 aa  143  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  48.78 
 
 
139 aa  142  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  46.21 
 
 
135 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  45.67 
 
 
133 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  46.56 
 
 
137 aa  136  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  44.7 
 
 
135 aa  134  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  44.7 
 
 
135 aa  134  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  44.7 
 
 
135 aa  134  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  44.72 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  44.72 
 
 
134 aa  130  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  46.51 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 
136 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  43.09 
 
 
136 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  43.09 
 
 
136 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 
136 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  43.9 
 
 
134 aa  124  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  45.16 
 
 
134 aa  124  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  42.28 
 
 
136 aa  123  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.28 
 
 
138 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  42.28 
 
 
136 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  42.28 
 
 
136 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  42.28 
 
 
136 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  40.8 
 
 
134 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  43.09 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 
135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  42.19 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  37.6 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
145 aa  94  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  30.58 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
149 aa  60.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  26.45 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  25.41 
 
 
163 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  29.9 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
155 aa  52  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 
140 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  24.8 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 
136 aa  50.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  24.59 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  25 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  27.56 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2936  thioesterase superfamily protein  24.56 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1972  thioesterase superfamily protein  25.42 
 
 
162 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1681  putative Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  27.97 
 
 
163 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  0.0917493 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  23.28 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  21.14 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.37 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  25 
 
 
154 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  20.9 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  23.08 
 
 
145 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  23.93 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  20.77 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  20.77 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1386  hypothetical protein  28.23 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.402075  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  22.61 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  20.77 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  21.14 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  21.14 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  21.14 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  26.55 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  21.55 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  22.31 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  23.21 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0960  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.6 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  20.69 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6384  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
156 aa  42.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  23.28 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  21.14 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  23.89 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
153 aa  42  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  24.19 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>