265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3477 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
144 aa  291  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  61.83 
 
 
147 aa  179  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  61.83 
 
 
147 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  57.86 
 
 
140 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  61.83 
 
 
148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  46.51 
 
 
154 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
142 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  43.28 
 
 
151 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  41.09 
 
 
157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  41.74 
 
 
145 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  37.6 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  37.74 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  31.48 
 
 
129 aa  66.6  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  36.28 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  25.78 
 
 
156 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  30.56 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  29.31 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
147 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  29.27 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
147 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
147 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6384  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  30.65 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  30.83 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 
135 aa  60.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  26.13 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  28.44 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
175 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  28.46 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  28.15 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  26.52 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  33.1 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4436  hypothetical protein  31.88 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  29.06 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  29.06 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  29.06 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  29.01 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  28.44 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  27.07 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  33.91 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  26.95 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  30.95 
 
 
203 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  33.64 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  27.72 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  31.53 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  31.53 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  25.95 
 
 
154 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  31.53 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  26.77 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  31.53 
 
 
181 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  31.53 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  31.53 
 
 
181 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.25 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 
283 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  28.79 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 
149 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  27.62 
 
 
135 aa  53.5  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  31.48 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>