254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5551 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  100 
 
 
154 aa  317  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  68.92 
 
 
157 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  68.92 
 
 
151 aa  219  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  68.84 
 
 
142 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  46.51 
 
 
144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 
147 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  43.09 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  43.44 
 
 
148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  41.8 
 
 
140 aa  114  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  39.64 
 
 
141 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  39.64 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  32.45 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  35.2 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.06 
 
 
149 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  33.33 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  35.46 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  33.8 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  35.83 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  32.48 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  37.21 
 
 
203 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  29.45 
 
 
164 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4436  hypothetical protein  26.47 
 
 
158 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
162 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
147 aa  60.5  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
135 aa  60.5  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  32.62 
 
 
150 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  33.6 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  33.56 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  26.98 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
175 aa  58.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  37.17 
 
 
181 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  37.17 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  37.17 
 
 
181 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  37.17 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  37.17 
 
 
149 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  37.17 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  37.27 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  26.95 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  30 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  40.79 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  28.67 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  31.69 
 
 
188 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  31.69 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  26.45 
 
 
161 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  32.41 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.45 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  28.81 
 
 
135 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6384  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  27.64 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1681  putative Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  29.29 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  0.0917493 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  33.93 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>