197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4476 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 142 aa  294  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  84.51 
 
 		 151 aa  260  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  84.4 
 
 		 157 aa  253  8e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  68.84 
 
 		 154 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  39.68 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  39.34 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  39.64 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  41.44 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  34.11 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  31.45 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  31.67 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  30.6 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1681  putative Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  32.5 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  0.0917493 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4436  hypothetical protein  28.93 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  30.47 
 
 		 181 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  30.89 
 
 		 181 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  30.89 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  30.89 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  30.89 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  30.89 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  32.79 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  31.36 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  30.23 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  29.82 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6384  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.71 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  23.93 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  25.6 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  27.46 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  27.2 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  29.27 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  26.45 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 160 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  25.22 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 188 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  28.95 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  25.37 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>