260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4309 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
156 aa  325  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  75.36 
 
 
139 aa  226  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  73.19 
 
 
140 aa  222  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  70.29 
 
 
140 aa  214  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  69.78 
 
 
140 aa  214  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  68.35 
 
 
139 aa  210  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  60.42 
 
 
147 aa  196  9e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 
139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  46.09 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  43.94 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  46.09 
 
 
143 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  46.09 
 
 
143 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  46.09 
 
 
143 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 
132 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  45.31 
 
 
146 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  45.31 
 
 
146 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  43.75 
 
 
147 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  44.62 
 
 
133 aa  120  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  44 
 
 
134 aa  120  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 
136 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  40.46 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  40.46 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  40.46 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  40.46 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  40.46 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  40.46 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  40.46 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  41.09 
 
 
139 aa  103  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  49.51 
 
 
213 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  36.09 
 
 
130 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  34.59 
 
 
130 aa  97.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  34.13 
 
 
137 aa  94.4  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 
136 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  29.01 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  27.48 
 
 
134 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  32.77 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  33.33 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  33.86 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
150 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.04 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  28.81 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  25.18 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  25 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
175 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  30.71 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.75 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  27.05 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  28.35 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  25 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 
143 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  23.36 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  25.37 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  23.19 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  38.75 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  26.09 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  33.77 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
144 aa  58.2  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  25.76 
 
 
147 aa  57.4  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
145 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  30.4 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>