244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1293 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 145 aa  298  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  98.62 
 
 		 145 aa  296  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  95.17 
 
 		 145 aa  289  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  95.17 
 
 		 145 aa  289  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  93.79 
 
 		 145 aa  285  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  93.1 
 
 		 145 aa  284  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  93.1 
 
 		 163 aa  265  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  85.21 
 
 		 203 aa  253  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  86.03 
 
 		 149 aa  244  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  86.03 
 
 		 181 aa  244  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  86.03 
 
 		 149 aa  244  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  86.03 
 
 		 181 aa  244  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  86.03 
 
 		 149 aa  244  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  80.99 
 
 		 149 aa  243  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  86.57 
 
 		 149 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  78.72 
 
 		 150 aa  238  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  77.46 
 
 		 149 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  74.83 
 
 		 175 aa  225  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  70.42 
 
 		 164 aa  220  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  77.94 
 
 		 147 aa  219  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  77.94 
 
 		 147 aa  219  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  70.21 
 
 		 162 aa  214  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  69.5 
 
 		 162 aa  212  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  69.5 
 
 		 153 aa  210  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  86.84 
 
 		 125 aa  205  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  66.21 
 
 		 147 aa  203  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  67.13 
 
 		 145 aa  200  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  74.05 
 
 		 153 aa  200  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  69.92 
 
 		 160 aa  197  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  70.15 
 
 		 188 aa  194  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  63.89 
 
 		 145 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  63.97 
 
 		 142 aa  186  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  63.12 
 
 		 147 aa  185  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  63.19 
 
 		 155 aa  184  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  61.38 
 
 		 153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  62.14 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  61.19 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  60 
 
 		 153 aa  178  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  59.29 
 
 		 144 aa  176  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  60.61 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  59.44 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  59.71 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  56.64 
 
 		 150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  56.43 
 
 		 143 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  55.88 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  52.78 
 
 		 148 aa  167  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  58.96 
 
 		 137 aa  167  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  57.97 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  55.22 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  58.65 
 
 		 137 aa  164  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  55.48 
 
 		 150 aa  163  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  56.06 
 
 		 136 aa  161  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  60.45 
 
 		 150 aa  159  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  55.24 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  55.24 
 
 		 143 aa  158  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  55.24 
 
 		 143 aa  157  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  53.44 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  53.57 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  51.15 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 143 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  49.24 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  48.53 
 
 		 147 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  48.53 
 
 		 147 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  48.53 
 
 		 147 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  47.22 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  43.88 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  43.07 
 
 		 151 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0152562 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  35.9 
 
 		 169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  34.97 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  37.6 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  37.01 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  34.65 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  30 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  35.34 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  32.87 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  34.48 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  32.17 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4734  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  32.52 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  29.33 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>