138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3272 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
149 aa  299  8.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  49.31 
 
 
145 aa  130  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  48.61 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  49.65 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  49.31 
 
 
145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  49.31 
 
 
145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  47.62 
 
 
203 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  50.74 
 
 
142 aa  128  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  47.22 
 
 
145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  48.92 
 
 
147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  47.62 
 
 
153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.25 
 
 
149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  46.1 
 
 
151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  48.61 
 
 
145 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  47.55 
 
 
175 aa  127  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  48.61 
 
 
163 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  48.2 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  48.95 
 
 
149 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  48.15 
 
 
156 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  48.95 
 
 
145 aa  123  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  45.83 
 
 
147 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  45.83 
 
 
147 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  45.83 
 
 
147 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  45.83 
 
 
150 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 
148 aa  121  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  46.43 
 
 
181 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  46.43 
 
 
181 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  46.43 
 
 
149 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  46.43 
 
 
149 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  46.43 
 
 
149 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  44.37 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  46.43 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  44.03 
 
 
142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  44.36 
 
 
147 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  44.52 
 
 
150 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  43.97 
 
 
147 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  46.26 
 
 
153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  42.03 
 
 
143 aa  117  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  41.61 
 
 
143 aa  117  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  45.26 
 
 
137 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 
147 aa  114  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  44.9 
 
 
153 aa  114  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  44.59 
 
 
153 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 
162 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  42.22 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  40.69 
 
 
164 aa  111  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  41.91 
 
 
138 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  44.85 
 
 
160 aa  110  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  42.25 
 
 
144 aa  110  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  44.12 
 
 
188 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  48 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  44.12 
 
 
147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  43.66 
 
 
143 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  45.86 
 
 
150 aa  106  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  42.65 
 
 
150 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  41.91 
 
 
150 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  43.07 
 
 
142 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 
143 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  39.57 
 
 
143 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  41.38 
 
 
155 aa  102  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  46.96 
 
 
125 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  36.88 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  32.08 
 
 
169 aa  91.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  34.42 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  27.86 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  25.81 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  34.68 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  30.77 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  30 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4734  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  30.08 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  26.36 
 
 
288 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  29.84 
 
 
134 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  29.23 
 
 
289 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
163 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  29.63 
 
 
161 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  25.86 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  24.82 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  26.47 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
180 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.98 
 
 
289 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.46 
 
 
285 aa  48.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  24.66 
 
 
286 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>