207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3994 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
143 aa  290  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  99.3 
 
 
143 aa  288  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  82.14 
 
 
150 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  55.71 
 
 
148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  62.5 
 
 
145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  56.64 
 
 
175 aa  169  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  57.14 
 
 
164 aa  169  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  59.7 
 
 
147 aa  168  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  60.45 
 
 
147 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  59.44 
 
 
145 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  56.64 
 
 
163 aa  161  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  61.19 
 
 
153 aa  161  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  61.19 
 
 
153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  56.43 
 
 
149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  55.94 
 
 
145 aa  157  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  59.56 
 
 
153 aa  157  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  58.52 
 
 
153 aa  157  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  55.24 
 
 
145 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  55.24 
 
 
145 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  55.24 
 
 
145 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  55.24 
 
 
145 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  57.35 
 
 
181 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  54.55 
 
 
145 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  57.14 
 
 
203 aa  156  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  54.23 
 
 
147 aa  156  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  57.35 
 
 
181 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  57.35 
 
 
149 aa  155  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  57.35 
 
 
149 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  57.35 
 
 
149 aa  155  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  57.78 
 
 
149 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  58.78 
 
 
160 aa  153  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  54.29 
 
 
149 aa  152  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  56.03 
 
 
153 aa  151  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  53.79 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  50.35 
 
 
147 aa  149  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  55.71 
 
 
150 aa  148  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  53.19 
 
 
144 aa  147  7e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  53.57 
 
 
162 aa  146  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  53.57 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  52.85 
 
 
136 aa  144  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 
148 aa  143  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  54.2 
 
 
142 aa  142  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  50.35 
 
 
147 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  55.3 
 
 
142 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  50.35 
 
 
147 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  50.35 
 
 
147 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  54.03 
 
 
156 aa  141  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  52.24 
 
 
143 aa  140  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  57.72 
 
 
142 aa  140  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  54.81 
 
 
188 aa  140  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  48.94 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  51.88 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  60.53 
 
 
125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  49.28 
 
 
155 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  47.26 
 
 
151 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  48.12 
 
 
138 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  48.2 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  48.51 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  50.37 
 
 
147 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  49.64 
 
 
147 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  50.77 
 
 
150 aa  124  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  45.93 
 
 
150 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 
150 aa  120  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  45.86 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  45.52 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 
149 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  36 
 
 
169 aa  97.8  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  34.72 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
161 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
139 aa  60.8  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  27.42 
 
 
161 aa  60.8  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
287 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  32.23 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  24.41 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
288 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  32.23 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  29.1 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
146 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
146 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  26.5 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  28.93 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  28.47 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>