85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0269 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 146 aa  293  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  97.26 
 
 		 146 aa  284  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  91.1 
 
 		 146 aa  268  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  90.41 
 
 		 146 aa  262  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  45.65 
 
 		 143 aa  140  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 		 143 aa  140  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  49.23 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  43.57 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  46.1 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  43.57 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  42.45 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  42.14 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.3 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  38.13 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  37.96 
 
 		 203 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  36.55 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  34.03 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  36.88 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  34.27 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 		 145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  36.88 
 
 		 162 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 		 145 aa  105  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  38.28 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  38.28 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  38.28 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  38.28 
 
 		 181 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  38.28 
 
 		 181 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  38.28 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 		 188 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  32.85 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  36.23 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  33.58 
 
 		 136 aa  98.6  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  34.53 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  36.03 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  36 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  34.06 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  35.11 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 155 aa  90.1  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  32.58 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  36.28 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  36.76 
 
 		 151 aa  87  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  32.09 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  34.53 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  24.67 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  28.36 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  26.17 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  25.35 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  26.24 
 
 		 292 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  23.49 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  25.53 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  29.73 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.18 
 
 		 285 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  19.33 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 286 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  25.53 
 
 		 287 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  23.36 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  24.59 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  23.33 
 
 		 136 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>