187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1058 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  100 
 
 		 151 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  47.52 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  47.26 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  46.81 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  44.06 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  42.66 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  43.57 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  45.26 
 
 		 145 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  40.82 
 
 		 143 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  44.53 
 
 		 145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  44.2 
 
 		 203 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  44.12 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  41.61 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  43.38 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  42.75 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  43.07 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  44.03 
 
 		 181 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  44.03 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  44.03 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  44.03 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  44.03 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  44.03 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  39.74 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  39.74 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  39.74 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  40.71 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  40.69 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 		 142 aa  103  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  41.04 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  38.41 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  39.42 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  42.54 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  38.62 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  39.42 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  37.32 
 
 		 150 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  39.86 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  39.42 
 
 		 153 aa  97.1  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  37.32 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  39.55 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  41.41 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  36.36 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 188 aa  94.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  39.55 
 
 		 162 aa  94.4  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  34.56 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  34.56 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  38.73 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  42.02 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  34.09 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  36.88 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  34.42 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  33.81 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  34.53 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  35.46 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  34.72 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  29.32 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  30.23 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  26.28 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  31.88 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  27.48 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  32.41 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  25.6 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  27.86 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  28.38 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  24.48 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  29.86 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>