97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4956 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
146 aa  291  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  91.78 
 
 
146 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  89.73 
 
 
146 aa  263  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  90.41 
 
 
146 aa  262  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  46.38 
 
 
143 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  47.01 
 
 
143 aa  135  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  47.69 
 
 
147 aa  133  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  43.15 
 
 
150 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  41.84 
 
 
150 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  45.26 
 
 
147 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  41.43 
 
 
144 aa  122  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  41.43 
 
 
142 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  40.71 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  41.79 
 
 
203 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  37.67 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  41.48 
 
 
160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  41.41 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  41.41 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  41.41 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  41.41 
 
 
149 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 
175 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  41.41 
 
 
181 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  41.41 
 
 
181 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  38.19 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 
147 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 
145 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
153 aa  106  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 
164 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  33.82 
 
 
148 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  37.24 
 
 
145 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.43 
 
 
149 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  36.69 
 
 
153 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  36.76 
 
 
147 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 
153 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 
163 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  35.21 
 
 
149 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
162 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
162 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  35.21 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  35.07 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  33.83 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 
188 aa  94.7  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
155 aa  94.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  36.36 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 
137 aa  94  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  38.94 
 
 
125 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  39.13 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  33.33 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  33.1 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 
142 aa  88.2  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 
137 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  34.06 
 
 
150 aa  83.6  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  31.34 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  31.65 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 
138 aa  80.1  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  33.09 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  28.91 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  29.63 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
292 aa  53.9  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  29.58 
 
 
154 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  26.28 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  27.97 
 
 
287 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  31.39 
 
 
149 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  24.65 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  23.36 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  19.17 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  18.33 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  24.11 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  23.31 
 
 
147 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  23.97 
 
 
286 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.35 
 
 
289 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.31 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  23.31 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.31 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  23.33 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1483  thioesterase superfamily protein  22.9 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.37599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>