More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2800 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
138 aa  285  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  61.07 
 
 
154 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  57.58 
 
 
154 aa  160  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  52.99 
 
 
285 aa  159  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  54.89 
 
 
286 aa  158  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  53.38 
 
 
292 aa  156  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  56.82 
 
 
289 aa  155  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  53.28 
 
 
149 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  54.48 
 
 
289 aa  154  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  56.2 
 
 
149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  51.13 
 
 
288 aa  152  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1433  thioesterase superfamily protein  52.55 
 
 
149 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  52.94 
 
 
287 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  53.49 
 
 
148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
287 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  51.88 
 
 
145 aa  151  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  49.26 
 
 
287 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  50.74 
 
 
145 aa  147  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  52.24 
 
 
287 aa  140  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.6 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0686  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.73 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  39.2 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2993  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.4 
 
 
153 aa  92.8  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.695823  normal  0.0154656 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.19 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.7 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  32.85 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  31.69 
 
 
143 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  37.7 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.2 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  38.52 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  34.75 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.62 
 
 
149 aa  77  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  38.52 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.97 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.81 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.59 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.59 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  35.29 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.29 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.31 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2411  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3997  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.77 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.666415  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.8 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.6 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.03 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  32.5 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.81 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.81 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.56 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.48 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.03 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  31.67 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  31.67 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  31.67 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  31.67 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  31.67 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4317  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  31.67 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  31.67 
 
 
161 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.1 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  29.79 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  33.82 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.82 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.15 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  32.85 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4540  hypothetical protein  32.85 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.85 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  32.09 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  34.95 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1224  thioesterase family protein  31.71 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0347226  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.76 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  30.14 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3302  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192522  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0557  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.977538  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.65 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  30.6 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>