More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4381 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 148 aa  300  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  66.89 
 
 		 154 aa  207  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  65.07 
 
 		 154 aa  205  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  57.86 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1433  thioesterase superfamily protein  52.74 
 
 		 149 aa  156  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  52.05 
 
 		 149 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  52.38 
 
 		 149 aa  153  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  53.85 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  53.49 
 
 		 138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  50.36 
 
 		 286 aa  149  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 		 292 aa  140  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  51.11 
 
 		 287 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  50.37 
 
 		 288 aa  136  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.37 
 
 		 285 aa  134  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.87 
 
 		 289 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  48.89 
 
 		 289 aa  128  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  48.15 
 
 		 287 aa  128  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  47.41 
 
 		 287 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  45.86 
 
 		 287 aa  124  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2993  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.15 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.695823  normal  0.0154656 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.55 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0686  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.61 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2411  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 		 135 aa  90.1  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  38.73 
 
 		 152 aa  88.6  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.34 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.88 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.16 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.88 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.37 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  41.8 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.62 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.62 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.9 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.86 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.36 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.9 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.2 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  39.05 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.85 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  39.05 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  39.05 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  39.05 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  39.05 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  39.05 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  39.05 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.86 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.86 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.95 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.57 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.06 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.07 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  33.08 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  33.08 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  33.08 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  33.08 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  33.08 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  33.08 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3302  thioesterase superfamily protein  41.11 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192522  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2464  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.31 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  32.33 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.71 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.54 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  27.54 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  29.86 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.3 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  31.88 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.84 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.62 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.93 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  32.28 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.28 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0557  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.977538  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4057  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.54 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.9 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  26.39 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>