240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2993 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2993  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  100 
 
 
153 aa  315  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.695823  normal  0.0154656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  43.15 
 
 
148 aa  114  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  37.31 
 
 
154 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  38.64 
 
 
154 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.69 
 
 
145 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.13 
 
 
145 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  40.16 
 
 
287 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 
287 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.86 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.66 
 
 
285 aa  94.4  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  33.33 
 
 
149 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  34.72 
 
 
287 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  38.4 
 
 
138 aa  92.8  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1433  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
149 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
292 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  34.27 
 
 
286 aa  88.2  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 
141 aa  88.6  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 
289 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
288 aa  85.1  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0686  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.32 
 
 
145 aa  83.6  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.88 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  30.41 
 
 
287 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.83 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2411  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.08 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  31.75 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  31.75 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  31.75 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  31.75 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  31.75 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  31.75 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  31.75 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.4 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.93 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  31.06 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.95 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.15 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.75 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  30.4 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.2 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.6 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.2 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.21 
 
 
136 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.75 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92060  predicted protein  29.66 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.691769  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.8 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.16 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0258  thioesterase  27.2 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024858  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2921  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 
136 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.06 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1224  thioesterase family protein  27.2 
 
 
143 aa  57.4  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0347226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.89 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.16 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.6 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01606  hypothetical protein  31.36 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1090  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.06 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.16 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3114  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.5 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  34.02 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0729  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.89 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4165  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.87 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161353  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2464  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.03 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.35 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1727  hypothetical protein  26.77 
 
 
144 aa  55.1  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.05 
 
 
148 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.974363  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  29.13 
 
 
148 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.32 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003917  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.81 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0190272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.36 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.36 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3072  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.17 
 
 
169 aa  54.7  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.14 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.16 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.16 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1106  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.89 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.157487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1979  thioesterase superfamily protein  30.94 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105854  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2889  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.23 
 
 
158 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.992552  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.82 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  28.15 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02688  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.46 
 
 
124 aa  53.9  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000607478  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  29.27 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2960  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.13 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0218826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>