More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1090 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1090  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  100 
 
 
149 aa  303  5.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0787  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.14 
 
 
148 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267485  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  45.26 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0258  thioesterase  47.46 
 
 
141 aa  115  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024858  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.09 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0924  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.62 
 
 
144 aa  111  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0795864 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2118  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.27 
 
 
158 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296225  normal  0.477442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  45.16 
 
 
150 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.86 
 
 
133 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.62 
 
 
128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.88 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5307  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  45.11 
 
 
143 aa  110  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1152  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  46.61 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0277  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.85 
 
 
144 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.28 
 
 
150 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  46.09 
 
 
136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003917  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.13 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0190272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0749  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.61 
 
 
150 aa  107  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  45.04 
 
 
132 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  45.76 
 
 
134 aa  107  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.04 
 
 
132 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2632  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.66 
 
 
147 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4057  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.8 
 
 
140 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4765  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40.97 
 
 
153 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.65 
 
 
136 aa  105  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3072  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.94 
 
 
169 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0472  thioesterase superfamily protein  43.09 
 
 
131 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.563842  normal  0.634378 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.45 
 
 
135 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.42 
 
 
159 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.94 
 
 
145 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.8 
 
 
134 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3616  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.1 
 
 
149 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1106  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  48.09 
 
 
135 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.157487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5232  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.26 
 
 
143 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200026  normal  0.202993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0729  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.88 
 
 
132 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.33 
 
 
159 aa  103  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  38.26 
 
 
151 aa  103  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.29 
 
 
145 aa  104  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2960  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  45.76 
 
 
133 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0218826  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1727  hypothetical protein  43.31 
 
 
144 aa  102  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2872  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  45.76 
 
 
133 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000275881  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  45.13 
 
 
143 aa  102  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01606  hypothetical protein  41.27 
 
 
126 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2906  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  45.76 
 
 
134 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.5 
 
 
159 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.5 
 
 
134 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1215  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.31 
 
 
134 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3091  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  44.07 
 
 
134 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  38.26 
 
 
151 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2137  thioesterase superfamily protein  42.98 
 
 
147 aa  102  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.31 
 
 
161 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.44 
 
 
134 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.31 
 
 
161 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6904  thioesterase superfamily protein  43.61 
 
 
149 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0171127  normal  0.306193 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  43.59 
 
 
164 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1894  acyl-CoA thioester hydrolase  42.98 
 
 
134 aa  100  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  43.59 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1245  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  44.07 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0111113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  43.59 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  43.22 
 
 
160 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2953  putative thioesterase protein  43.85 
 
 
141 aa  99.4  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0150824  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  43.59 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  43.59 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  43.59 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  43.59 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  43.41 
 
 
139 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1224  thioesterase family protein  41.94 
 
 
143 aa  97.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0347226  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0332  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  46.04 
 
 
159 aa  97.8  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.28 
 
 
146 aa  97.1  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.94 
 
 
140 aa  97.1  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40.94 
 
 
161 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  44.07 
 
 
134 aa  96.7  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1390  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.68 
 
 
132 aa  96.7  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00302966  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00696  predicted acyl-CoA thioesterase  46.73 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000730216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.73 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2228  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.67 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.159905  hitchhiker  0.000289051 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0765  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  46.73 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133795  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  46.73 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2919  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  46.73 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000323269  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1234  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  41.86 
 
 
134 aa  96.7  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.128192 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  46.73 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  46.73 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.74 
 
 
134 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  46.73 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1853  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.98 
 
 
132 aa  96.7  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107665  normal  0.755502 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.09 
 
 
129 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1644  hypothetical protein  39.85 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.996621  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.74 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0945  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.26 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1214  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.859401  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2718  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.8 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.401419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0807  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  46.73 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000852325  normal  0.479233 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0902  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  46.73 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000167631  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0780  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  46.73 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000472439  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0840  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  46.73 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  0.646292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0871  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  46.73 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0203461  normal  0.184267 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.41 
 
 
161 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3114  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144854  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.41 
 
 
161 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.85 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.974363  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>