More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2632 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2632  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  100 
 
 
147 aa  296  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  80.85 
 
 
151 aa  234  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  77.78 
 
 
151 aa  230  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3616  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  72.34 
 
 
149 aa  212  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3175  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  52.86 
 
 
154 aa  155  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  53.28 
 
 
148 aa  140  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.974363  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1106  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  56.69 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.157487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3072  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  51.45 
 
 
169 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0729  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  57.48 
 
 
132 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1214  thioesterase superfamily protein  50.36 
 
 
156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.859401  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1924  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  49.28 
 
 
191 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5307  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  50 
 
 
143 aa  134  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1293  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  50 
 
 
154 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4165  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.94 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161353  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0749  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  56 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4765  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  50.75 
 
 
153 aa  131  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5232  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  51.49 
 
 
143 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200026  normal  0.202993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6904  thioesterase superfamily protein  49.65 
 
 
149 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0171127  normal  0.306193 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0148  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  51.2 
 
 
146 aa  130  7.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.01 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  47.01 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4268  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  50 
 
 
163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1644  hypothetical protein  47.86 
 
 
149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.996621  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3520  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  49.26 
 
 
153 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.53 
 
 
153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2384  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.94 
 
 
204 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29549  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2118  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  47.18 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296225  normal  0.477442 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  45.74 
 
 
136 aa  124  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.33 
 
 
145 aa  123  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0924  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  51.22 
 
 
144 aa  121  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0795864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  46.72 
 
 
129 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0277  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  47.37 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  46.72 
 
 
134 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0472  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 
131 aa  114  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.563842  normal  0.634378 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0787  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.75 
 
 
148 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267485  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  49.58 
 
 
131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.97 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  49.22 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.97 
 
 
134 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.8 
 
 
133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.76 
 
 
134 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.33 
 
 
141 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1090  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.66 
 
 
149 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  42.52 
 
 
164 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  42.15 
 
 
164 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  42.52 
 
 
161 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  42.52 
 
 
161 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  42.15 
 
 
161 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  46.67 
 
 
135 aa  104  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  42.15 
 
 
164 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  42.52 
 
 
161 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.28 
 
 
143 aa  104  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  41.32 
 
 
134 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0258  thioesterase  44 
 
 
141 aa  104  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024858  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  40.94 
 
 
160 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  44.12 
 
 
148 aa  103  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  43.07 
 
 
155 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.94 
 
 
150 aa  103  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.22 
 
 
134 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.98 
 
 
161 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.8 
 
 
150 aa  102  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.86 
 
 
133 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.86 
 
 
146 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.53 
 
 
161 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.98 
 
 
161 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.53 
 
 
161 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.86 
 
 
133 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.9 
 
 
137 aa  101  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.5 
 
 
136 aa  101  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  44.26 
 
 
128 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.55 
 
 
134 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.86 
 
 
155 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40.31 
 
 
159 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0332  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.67 
 
 
159 aa  100  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1013  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.15 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505536  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0063  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.28 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.57846  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0064  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.28 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246744  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.5 
 
 
161 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.98 
 
 
161 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  41.91 
 
 
134 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  43.44 
 
 
130 aa  98.2  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.65 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  42.52 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4540  hypothetical protein  43.31 
 
 
148 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.23 
 
 
159 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.98 
 
 
159 aa  97.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1224  thioesterase family protein  43.8 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0347226  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0658  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  38.97 
 
 
134 aa  97.1  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1727  hypothetical protein  38.81 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1215  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.72 
 
 
134 aa  96.7  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4057  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.13 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40.94 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  38.97 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.27 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0945  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.09 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  38.97 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1064  hypothetical protein  41.94 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02688  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.62 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000607478  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2137  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>