54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1979 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1979  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 136 aa  272  9e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  44.96 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  44.96 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  38.81 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  40.94 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3302  thioesterase superfamily protein  39.71 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192522  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.14 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.32 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 		 288 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0557  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.977538  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 		 289 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0686  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.43 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  30.6 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  30.43 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 		 292 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  30.83 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.22 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.3 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  31.21 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.68 
 
 		 285 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2993  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.94 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.695823  normal  0.0154656 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  30.66 
 
 		 287 aa  53.9  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  32.59 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1433  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  29.2 
 
 		 287 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  31.39 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  27.33 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  37.1 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.41 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1366  thioesterase superfamily protein  27.71 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  29.79 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 156 aa  43.5  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  28.15 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.92 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22071  hypothetical protein  33.78 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  26.24 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  26.24 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  32.84 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.56 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92060  predicted protein  27.91 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.691769  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 145 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>